Radiomics(レディオミクス)とは?
CT・MRI・PET などの医療画像は、医師が“見て”診断するもの——そう思っていませんか? Radiomics は、その画像から人間の目では捉えきれない膨大な数値特徴量を自動抽出し、腫瘍の性質・治療効果・予後を定量的に読み解く新しい学問分野です。
たとえば同じ大きさの腫瘍でも、内部が均一か・まだらか、輪郭が滑らかか・トゲトゲかで、悪性度や治療への反応は大きく異なります。Radiomics はこうした「テクスチャ(質感)」や「形状」を Mean・Entropy・Contrast・Sphericity といった特徴量に翻訳し、機械学習や統計モデルと組み合わせることで、非侵襲の画像バイオマーカーを生み出します。
本サイトでは、これらの特徴量を合成画像を動かしながらリアルタイムに計算して体験できます。「数式の意味」と「画像が変わると数値がどう動くか」を、同時に・直感的に掴んでください。
Radiomics のワークフロー
画像取得
CT / MRI / PET で腫瘍を撮像(再構成条件の標準化が重要)。画像はボクセル(最小単位=3D版の画素)の集まり。
領域抽出 (ROI: Region of Interest)
腫瘍など関心領域を区切る(手動/自動セグメンテーション)。赤線が ROI。
前処理・離散化
リサンプリング・強度の正規化・グレーレベル離散化(IBSI準拠)。必要に応じて画像フィルタも適用(下記)。
特徴量抽出
強度・テクスチャ・形状から数百の特徴量を算出。本サイトの主役。
モデル構築
機械学習・統計で診断/予後/治療効果を予測する画像バイオマーカーへ。
前処理フィルタ ― LoG・ウェーブレット(応用)
特徴量は元画像だけでなく、フィルタを掛けて強調した「派生画像」からも抽出できます。これにより、元画像では見えにくいスケール(粗い/細かい構造)の情報を取り出せます。代表的な2つを紹介します。
ガウスぼかしの後にラプラシアン(2階微分)を掛け、エッジや斑点状の構造を強調するフィルタです。パラメータ σ(シグマ)を小さくすると細かな質感が、大きくすると粗い構造が際立ちます。σ を変えた複数枚の派生画像から特徴量を取り、マルチスケールに腫瘍内部の不均一性を捉えます。
画像を低周波(おおまかな濃淡 = L)と高周波(細部・エッジ = H)に分解します。2D では各軸に L/H を掛け合わせ LL・LH・HL・HH の4成分(3D では8成分)に分け、各成分の画像から特徴量を抽出。方向や周波数ごとのテクスチャを別々に評価できます。
11グループ・172特徴量を探検する
IBSI 172特徴量 網羅チェック
| グループ | 特徴量数 | 集約方式 (本サイト) | ページ |
|---|---|---|---|
| Shape 形状Morphological features | 29 | 3D | Shape |
| 局所強度Local intensity features | 2 | 2D近似 | 局所強度 |
| 強度統計Intensity-based statistics | 18 | — | 強度統計 |
| IH 強度ヒストグラムIntensity histogram | 23 | 2D | Histogram |
| IVH 強度体積ヒストグラムIntensity-volume histogram | 5 | — | IVH |
| GLCM 共起行列Grey level co-occurrence matrix | 25 | 2D averaged | GLCM |
| GLRLM ランレングスGrey level run length matrix | 16 | 2D averaged | GLRLM |
| GLSZM サイズゾーンGrey level size zone matrix | 16 | 2D | GLSZM |
| GLDZM 距離ゾーンGrey level distance zone matrix | 16 | 2D | GLDZM |
| NGTDM 近傍トーン差分Neighbourhood grey tone difference matrix | 5 | 2D | NGTDM |
| NGLDM 近傍依存Neighbouring grey level dependence matrix | 17 | 2D | NGLDM |
| 合計 Total | 172 | — | 全11グループ |
※ ここに示した 2D / 3D は本サイトでの計算方法です。IBSI の定義上、ほとんどのテクスチャ・ヒストグラム特徴量は2D でも 3D でも計算できます。「2D」と書いた特徴量が 2D 専用という意味ではありません(本サイトは分かりやすさと速度のため主に 2D を採用しています)。
作成者・ご利用にあたって
駒澤大学 医療健康科学部 馬込研究室
本サイト「Radiomics大全」は、放射線治療・医用画像解析の教育普及を目的に 馬込研究室 が作成しています。研究室の活動については https://magome.wixsite.com/laboratory をご覧ください。
計算は IBSI(Image Biomarker Standardisation Initiative)の特徴量定義に準拠し、公開デジタルファントムの参照値で検証しています。